هزینه‌های نامتعارف که در سال‌های اخیر در بدو ورود از سوی مدارس گرفته می‌شود سبب اعتراض والدین شده و این در حالی است که پرداخت هزینه برای تحصیل دانش‌آموزان در مدارس دولتی معمولا از سوی آموزش و پرورش مشخص شده است.

رئیس سازمان مدارس و مراکز غیردولتی و توسعه مشارکت‌های مردمی وزارت آموزش و پرورش از کیفی سازی مدارس غیردولتی و توانمندسازی معلمان خبر داد و گفت: تنها بخش اندکی از اعتباراتی که باید از سوی بانک مرکزی به مدارس غیردولتی تخصیص می‌یافت، پرداخت شده است .

مدیرکل ارزیابی عملکرد و پاسخگویی به شکایات وزارت آموزش‌وپرورش با بیان اینکه دریافت هزینه در موقع ثبت‌نام از والدین دانش‌آموزان خلاف مقررات است گفت: مبالغ دریافتی از سوی مدرسه برای بیمه، کتاب و هزینه لباس هنرستانی‌ها تعریف شده است لذا اخذ بیشتر پول از سوی مدرسه، قطعا از سوی تیم بازرسی آموزش و پرورش پیگیری می‌شود.